Resolving eukaryotic river biofilm communities using long-read sequencing for biomonitoring
该研究通过比较 Illumina 短读长与 PacBio 长读长测序技术在河流生物膜真核微生物群落分析中的表现,证实长读长测序能显著提升 18S rRNA 基因的分类学分辨率并更准确地反映群落多样性,从而为高分辨率的水质生物监测提供了更优策略。
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分子生物学探索着生命的核心密码,揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论,而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science,我们致力于打破学术壁垒,让这些前沿发现触手可及。
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该研究通过比较 Illumina 短读长与 PacBio 长读长测序技术在河流生物膜真核微生物群落分析中的表现,证实长读长测序能显著提升 18S rRNA 基因的分类学分辨率并更准确地反映群落多样性,从而为高分辨率的水质生物监测提供了更优策略。
该研究揭示了拟南芥长链非编码 RNA ACHLYS 通过与剪接因子 NSRa 相互作用促进其相分离并调控核斑点凝聚体,进而特异性地调节替代剪接事件以影响侧根发育的新机制。
该研究发现黏连蛋白(cohesin)通过促进 Pol II 招募并作为转录“守门人”暂时延缓暂停释放,从而在稳态下因补偿效应维持基因表达稳定,但在刺激响应中通过确保足够的暂停时间以保障转录过程的持续性和质量,进而为理解黏连蛋白相关疾病提供了新机制。
该研究通过高分辨率染色质构象捕获技术证明,FACT 复合物通过维持核小体完整性并限制染色质结合因子的扩散,从而在体内保障活性启动子的纳米结构域拓扑及长程染色质架构。
本文提出了一种名为“淀粉样蛋白堆积差异”(APD)的新指标,用于通过量化交叉β堆积相互作用和侧链取向的差异来比较同一蛋白的不同淀粉样纤维结构,并验证了该指标能有效区分与不同疾病相关的淀粉样蛋白构象。
该研究揭示了 PARP6 通过 ADP-核糖基化修饰波形蛋白(vimentin)抑制 RhoA 信号通路及肌动蛋白应力纤维形成,从而阻止心肌成纤维细胞活化并发挥心脏保护作用,其表达缺失会加剧心脏纤维化。
本研究通过 X 射线晶体学、等温滴定量热法和冷冻电镜技术,解析了拟杆菌属*Bacteroides thetaiotaomicron*中负责利用糊精的“糊精利用体”(dextran utilisome)的高分辨率结构及其动态构象变化,揭示了其核心 SusCD 复合物与辅助蛋白(GHdex 和 SBGPdex)协同结合底物的分子机制。
该研究通过高分辨率冷冻电镜结构分析发现,人源 VPS34 复合物 II 中 VPS15 亚基上存在一个可能为进化起源的 RAB5 结合位点,并揭示了该位点与 VPS34 C2 域结合位点的协同作用及其在真核生物进化中从单一结合位点向双结合位点扩展以适应复杂内吞系统的机制。
该研究在埃塞俄比亚西部奥罗米亚地区通过跨断面调查证实,绵羊中巴氏杆菌科细菌(尤其是多杀性巴氏杆菌)的总检出率为 21.1%,且患病状态和年龄是显著的风险因素,凸显了针对肺炎性巴氏杆菌病进行分子鉴定及制定针对性防控措施的必要性。
本文提出了一种基于图卷积网络的多模态人工智能框架,通过整合蛋白质的全局理化特征与局部药效团信息,有效提升了药物发现中蛋白质构象选择及结合状态预测的准确性与鲁棒性。